Klima v Peru by se dalo rozdělit na dvě období a to na období sucha a na období dešťů, ale závisí to také na geografické oblasti. Střídání ročních období se projevuje spíše různým množstvím srážek než střídáním teploty. Srážky jsou také rozdílné v různých částech země. Pobřeží a západní svahy And patří k nejsušším oblastem. Studený Humboltův proud zabraňuje proudění teplého vzduchu od oceánu a tím také srážkám (průměrná teplota v Limě je 20 stupňů a průměrné množství srážek za rok je 45 mm). Na náhorních plošinách je podnebí mírné se sezónními srážkami. Nejvyšší partie hor patří do chladného sněžného pásma. V tropických pralesech na východě země je podnebí teplé a vlhké s velkým množstvím srážek (Iquitos -průměrná teplota 26,5 stupňů a průměr srážek za rok je 2850 mm). Zjednodušeně platí, že když je období sucha (léto), na pobřeží je období dešťů, nebo-li zima na horách.
V Peru můžete narazit na podnebí dusných tropů až po sněhem pokryté vrcholky hor s řídkým vzduchem. Obecně se dá říci, že nejvhodnější doba pro cestování do pobřežních oblastí je od listopadu do dubna (17-29 °C), do hor od dubna do listopadu a do pralesů od června do srpna.
Lima, Peru | ||||||||||
Měsíc | Prům. počet hodin slunečna | Teplota | Index nepohody z horka a vlhka | Relativní vlhkost | Prům. srážky (mm) | Deštivé dny (+0.25 mm) | ||||
Průměr | Rekord | |||||||||
Min | Max | Min | Max | Dopo | Odpo | |||||
Leden | 6 | 19 | 28 | 15 | 32 | střední | 93 | 69 | 3 | 0,5 |
Únor | 7 | 19 | 28 | 15 | 33 | střední | 92 | 66 | 0 | 0,1 |
Březen | 7 | 19 | 28 | 16 | 33 | střední | 92 | 64 | 0 | 0,1 |
Duben | 7 | 17 | 27 | 13 | 34 | střední | 93 | 66 | 0 | 0,2 |
Květen | 4 | 16 | 23 | 11 | 29 | nízký | 95 | 76 | 5 | 0,8 |
Červen | 1 | 14 | 20 | 9 | 27 | – | 95 | 80 | 5 | 1 |
Červenec | 1 | 14 | 19 | 9 | 27 | – | 94 | 77 | 8 | 1 |
Srpen | 1 | 13 | 19 | 10 | 27 | – | 95 | 78 | 8 | 2 |
Září | 1 | 14 | 20 | 11 | 26 | – | 94 | 76 | 8 | 1 |
Říjen | 3 | 14 | 22 | 12 | 26 | – | 94 | 72 | 3 | 0,2 |
Listopad | 4 | 16 | 23 | 11 | 29 | nízký | 93 | 71 | 3 | 0,2 |
Prosinec | 5 | 17 | 26 | 13 | 31 | střední | 93 | 70 | 0 | 0,1 |
Problémy přináší fenomén zvaný El Niňo, který vyvolává střídání teplých a studených vzdušných hmot nad mořem. To způsobuje intenzivní srážky, časté záplavy a odnos půdy do moře. Změny teploty moře snižují objem planktonu a způsobují úhyn ryb a ptactva. Právě tímto fenoménem byly postiženy v 80. letech pobřežní vody, což způsobilo velký úhyn ryb.